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RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究

點(diǎn)擊次數(shù):967  更新時(shí)間:2023-10-24

在生命科學(xué)領(lǐng)域,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)正逐漸成為研究細(xì)胞生命活動(dòng)的重要工具。它可以幫助我們深入了解細(xì)胞在特定生理狀態(tài)下的基因表達(dá)模式,為疾病診斷、藥物研發(fā)和生物醫(yī)學(xué)研究提供有力支持。


一、RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究對(duì)象

RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究對(duì)象包括細(xì)胞類型、組織類型、生理狀態(tài)等。在細(xì)胞類型方面,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以對(duì)各種人體細(xì)胞進(jìn)行深入研究,揭示不同細(xì)胞之間的基因表達(dá)差異。在組織類型方面,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以分析不同組織中的基因表達(dá)譜,揭示組織特異性的基因表達(dá)模式。在生理狀態(tài)方面,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以研究細(xì)胞在不同生理狀態(tài)下的基因表達(dá)變化,如生長、分化、凋亡等。


二、RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究方法

RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究方法主要包括高通量測(cè)序、表達(dá)譜分析、生物信息學(xué)處理等。高通量測(cè)序技術(shù)可以快速、準(zhǔn)確地測(cè)定基因組的全部轉(zhuǎn)錄本,從而獲得全面的基因表達(dá)信息。表達(dá)譜分析則可以對(duì)大量基因進(jìn)行同時(shí)檢測(cè),揭示基因表達(dá)的差異和協(xié)同性。生物信息學(xué)處理則可以對(duì)測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行深入挖掘,解析出基因表達(dá)的復(fù)雜模式。


三、RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究應(yīng)用

RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究應(yīng)用廣泛,包括功能研究、疾病診斷、藥敏測(cè)試等。在功能研究方面,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以幫助我們深入了解基因的功能和作用機(jī)制。在疾病診斷方面,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以識(shí)別與疾病相關(guān)的關(guān)鍵基因,為疾病的早期診斷和預(yù)后預(yù)測(cè)提供依據(jù)。在藥敏測(cè)試方面,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以預(yù)測(cè)藥物對(duì)細(xì)胞的效應(yīng),為新藥研發(fā)和個(gè)性化治療提供支持。


四、RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)的研究對(duì)象主要是轉(zhuǎn)錄組,即細(xì)胞內(nèi)所有基因及其表達(dá)產(chǎn)物的信使RNA(mRNA)和非編碼RNA等。

  1. mRNA:mRNA是基因表達(dá)過程中的關(guān)鍵分子,它攜帶了從DNA轉(zhuǎn)錄而來的信息,并進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)中進(jìn)行翻譯,生成具有特定功能的蛋白質(zhì)。RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)可以通過對(duì)mRNA的研究,揭示基因的表達(dá)水平和轉(zhuǎn)錄本,從而深入探究生物過程和疾病機(jī)理。

  2. 非編碼RNA:除了mRNA,RNA轉(zhuǎn)錄組學(xué)還研究非編碼RNA,如微RNA(miRNA)和長非編碼RNA(lncRNA)等。這些非編碼RNA在基因表達(dá)調(diào)控中發(fā)揮重要作用,可以影響基因轉(zhuǎn)錄、翻譯和蛋白質(zhì)功能等。通過對(duì)非編碼RNA的研究,可以進(jìn)一步揭示基因表達(dá)的復(fù)雜性和調(diào)控機(jī)制。


五、重要研究工具

       PAXgene血液RNA管用于立即穩(wěn)定細(xì)胞內(nèi)RNA,從而產(chǎn)生準(zhǔn)確且可重復(fù)的基因表達(dá)數(shù)據(jù)。PAXgene血液RNA管含有一種專有試劑,可在采集后立即穩(wěn)定細(xì)胞內(nèi)RNA。細(xì)胞內(nèi)RNA在室溫下穩(wěn)定長達(dá)三天或在2-8°C下穩(wěn)定長達(dá)五天。PAXgene試管可以在-20°C至-70°C的溫度下冷凍,以便長期儲(chǔ)存。

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PAXgene血液RNA管特點(diǎn):

◆ 體外診斷使用,具有CE-IVD標(biāo)志,符合歐盟98/79/EC 指令

◆ 整合的系統(tǒng),用于采集、穩(wěn)定和純化胞內(nèi)RNA

◆ 提供在分析工作進(jìn)行之前的樣本標(biāo)準(zhǔn)化處理

◆ 在 18~25℃下,RNA穩(wěn)定可長達(dá)3天

◆ 在-20℃ 或 -70℃條件下至少穩(wěn)定50個(gè)月



參考文獻(xiàn)

  1. Friedman, N. et al. (2009). The landscape of the regulatory elements identified by integration of ENCODE with the Catalogue of Somatic Mutations in Cancer (COSMIC). Genome Res 19, 92-104.

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